据《中华人民共和国进出口商品检验法》、《中华人民共和国进出境动植物检疫法》、《中华人民共和国国境卫生检疫法》等有关法律法规规定，宜昌检验检疫局主要职责是：
    1、贯彻执行出入境卫生检疫、动植物检疫和进出口商品检验法律、法规和政策规定及工作规程，负责所辖区域的出入境检验检疫、鉴定和监管工作；
    2、实施出入境卫生检疫、传染病监测和卫生监督；
    3、实施出入境动植物检验检疫和监督管理；
    4、实施进出口商品的法定检验和监督管理，负责进出口商品鉴定管理工作，实施外商投资财产鉴定，办理进出口商品复验；
    5、实施对进出口食品及其生产单位的卫生注册登记和对外注册管理，实施进口安全质量许可和出口质量许可以及与进出口有关的质量认证认可工作；
    6、实施国家实行进口许可制度的民用商品入境验证管理工作，按规定承担技术性贸易壁垒和检疫协议的实施工作；
    7、管理出入境检验检疫证单、标志及签证、标识、封识，负责出口商品普惠制原产地证和一般原产地证的签证工作；
    8、负责所辖区域出入境检验检疫业务的统计工作，收集国外传染病疫情、动植物疫情，分析、整理、提供有关信息。  

（一）宜昌局
　　1、办公室
　　协助局领导协调机关日常工作和督察督办，组织重要会议和活动，负责财务、政工、人事、监察、后勤、秘书、保密、档案、信息宣传、安全保卫等工作，完成局领导交办的其它工作。
    2、综合业务科
　　负责有关检验检疫法规工作及执法督查、稽查工作，承办行政处罚、复议、诉讼和协助司法调查及法制宣传教育，负责全局的检验检疫业务质量管理工作，负责市场抽查与监管等工作，负责管理和接受申请进出口卫生注册、检疫注册和进出口安全质量许可工作，负责在出口企业中宣贯ISO9000质量体系标准及相关信息的收集。
    3、一科
　　负责出入境动植物及其产品和其它应检物的检验检疫和监督管理，参与出入境动植物及其产品的卫生和检疫注册的考核与监督检查，负责出入境卫生检疫和监督管理，负责进出口食品等商品的卫生、质量检验和监督管理，参与进出口食品卫生注册的考核和监督检查，负责进出口化工矿产品、冶金产品等商品的法定检验和监督管理，参与对分管商品的进出口安全质量许可的考核和监督检查，负责上述工作的业务统计、质量分析和信息收集工作。
    4、二科
　　负责辖区内除三峡工程进境设备以外的进出口机电仪、成套设备、车辆、出口包装及包装材料等商品的法定检验和监督管理，参与分管商品的进出口安全质量许可的考核和监督检查，负责外商投资财产价值鉴定工作，负责上述工作的业务统计、质量分析和信息收集工作。
    5、三科
　　负责进出口轻工产品、纺织原料及制品等商品的法定检验和监督管理，参与分管的进出口商品安全质量许可的考核和监督检查、负责上述工作的业务统计、质量分析和信息收集工作。
    6、检务科
　　负责出入境检验检疫证书、证单的签发工作，负责检验检疫报检、计费、签证、放行及流程管理，负责普惠制原产地证和一般原产地证的签发和监督管理，负责检验检疫业务统计和计算机信息系统的管理工作。
 　　（二）三峡办
　　负责三峡工程入境设备、材料及集装箱检验检疫和监督管理工作，负责所做工作的业务统计、质量分析和信息收集工作。